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未命名__2024-04-24-11_17_57

人WGS-二代测序

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本项目基于二代测序平台对人源样本进行全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS),利用生物信息学手段得到全基因组序列,全面挖掘DNA水平的遗传变异,包括单核苷酸位点变异(Single Nucleotide Variants,SNV)和结构变异,为筛选疾病的致病及易感基因,研究发病及遗传机制,以及推断种群进化等提供重要信息。

 

实验流程

 

(PCR-free建库,无“PCR扩增”步骤)

 

 

技术参数

 

样本类型

建议送样量(普通建库)

建议送样量(PCR-free建库)

DNA

gDNA

总量≥400ng,浓度≥5ng/µL

总量≥2µg,浓度≥20ng/µL

cfDNA

总量≥20ng,浓度≥0.5ng/µL

——

人体

组织

常规材料≥200mg,特殊材料>500mg

常规材料≥400mg,特殊材料>1g

细胞

≥2*106个细胞

≥4*106个细胞

全血

≥4mL,凝血不能提取

≥8mL,凝血不能提取

FFPE

相当于5-10µm蜡卷,≥10片;

相当于5-10µm蜡卷,≥20片

羊水

3-5mL

6-10mL

 

 

交付指标

 

建库策略

测序平台

测序策略

交付周期

交付内容

普通建库

PCR-free建库

NovaSeq X Plus
DNBSEQ-T20X2
DNBSEQ-T7

PE150

7个自然日

交付fastq文件(建库测序)

交付vcf和gvcf文件(建库测序分析)

 

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