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未命名__2024-04-22-11_08_39

基因组survey-二代测序

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基因组Survey基于小片段文库的低深度测序数据 ,通过K-mer分析 ,有效的评估基因组大小、GC含量、杂合度以及重复序列的含量等信息,是全面了解某一物种基因组特征的有效方法,为后续的全基因组 de novo 测序的组装策略的制定提供理论依据。

 

送样建议

样本类型

建议送样量

DNA样本

总量 ≥ 400ng

植物(根、茎叶、花、果实/种子、幼苗)

常规材料≥500mg,特殊材料≥1g

动物

组织

常规材料≥200mg,特殊材料≥500mg

细胞

≥2*106 细胞

全血

哺乳动物全血≥400µL , 鸟类,鱼类 ≥100µL;
凝血不能提取

FFPE

相当于5-10µm蜡卷,≥10片

羊水

3-5mL

 

 

交付指标

测序平台

测序策略

交付周期

交付内容

NovaSeq X Plus
DNBSEQ-T7

PE150

10个自然日

交付标准分析报告

 

 

分析流程

 

 

部分结果展示

部分结果展示:图A,K-mer频率分布图;图B,Contig 10kb窗口GC含量与平均覆盖深度的散点分布图

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