样本类型 |
建议送样量(普通建库) |
建议送样量(PCR-free建库) |
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DNA样本 |
总量≥400ng,浓度≥5ng/µL |
总量≥2µg,浓度≥20ng/µL |
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植物(根、茎叶、花、果实/种子、幼苗) |
常规材料≥500mg,特殊材料≥1g |
常规材料≥1g,特殊材料≥2g |
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动物 |
组织 |
常规材料≥200mg,特殊材料≥500mg |
常规材料≥400mg,特殊材料>1g |
细胞 |
≥2*106 细胞 |
≥4*106 个细胞 |
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全血 |
哺乳动物全血≥400µL , 鸟类,鱼类 ≥100µL; |
哺乳动物全血≥800µL , 鸟类,鱼类 ≥200µL; |
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FFPE |
相当于5-10µm蜡卷,≥10片 |
相当于5-10µm蜡卷,≥20片 |
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羊水 |
3-5mL |
6-10mL |
动植物WGS-二代测序
全基因组测序(WGS)是一种高通量测序技术,能够个体或群体水平上挖掘大量遗传多态性信息,包括SNV(SNP和INDEL)、拷贝数变异(CNV)和结构变异(SV),此技术在动植物研究领域的应用十分广泛,可揭示不同品种的遗传结构、驯化机制与种群进化历史,它在动植物育种研究有着极其重要的应用价值。
实验流程
(PCR-free建库,无“PCR扩增”步骤)
送样建议
交付指标
建库策略 |
测序平台 |
测序策略 |
交付周期 |
交付内容 |
普通建库 PCR-free 建库 |
NovaSeq X Plus |
PE150 |
7个自然日 |
交付fastq文件(建库测序) 交付vcf和gvcf文件(建库测序分析) 交付完整分析报告(建库测序分析) |
分析流程
结果展示
部分结果展示:图A,比对到基因组的序列占比; 图B,去重复后的序列占比对到基因组的序列数的比例; 图C,基因组覆盖深度分布图; 图D,基因组盖深度累计分布图; 图E,基因水平注释的变异位点统计饼图。