Kinnex全长转录组测序
Kinnex全长转录组测序是基于PacBio Revio平台的HiFi测序技术获得物种转录组信息的方法，其可以直接获得完整全长转录本序列及结构信息，无需打断和拼接，克服转录本拼接短、信息不完整的难题，实现可变剪切及融合基因等结构变异的研究
产品优势
- 超高通量：SPRQ 试剂更新后1张Revio cell能产生＞40M HiFi reads
- 超高准确性：数据准确率约 99.9%，无需短读长测序数据纠错
- 超低成本：Kinnex 全长转录组方案提高测序通量，降低建库测序成本
- 直接获取全长转录组：获得 5'-3' 的全长Isoform，无需拼接，准确性高
- 高准确的结构分析：提供高精度 ORF 预测和可变剪接点检测，识别新基因和可变剪接亚型
- 可扩展的定量分析：近饱和全长转录组测序可直接进行基因 / 转录本定量分析，无需二代测序技术
- 灵活的数据量选择：可按研究目的和样本量，选单样或混样测序，降低批次效应
应用方向
医学
- 探索转录本的区域特异性表达：全长转录组测序可以提供转录本的全面视图，包括它们的序列、结构、表达等信息。选取不同组织或同一组织不同区域的样本，可以观察到转录本结构特征和基因/转录本表达随区域的变化，从而了解不同细胞类型或组织区域的转录本结构和表达特征
- 揭示生长发育调控机制：选取不同发育时间点样本，可以观察到转录本结构特征和基因/转录本表达随时间的变化，从而揭示细胞分化、发育或疾病进程中的动态变化，从而了解基因表达调控网络的动态调控机制
- 鉴定疾病/肿瘤中的特异性 Isoforms：获得病变、癌变组织或细胞的全长转录组，构建疾病/肿瘤样本的全面转录本数据集，结合分组情况鉴定疾病/肿瘤特异性转录本，寻找疾病/肿瘤诊断和防治的生物标志物
- 发现肿瘤相关融合基因：全长转录组测序在检测融合基因方面具有独特的优势，这对于癌症研究尤为重要。对于部分可能发生融合基因的癌症如前列腺癌、白血病等，有助于探究癌症致病机理
农学
- 基因组注释体系优化：对于有参可以完善参考基因集，提升基因组注释。对于无参物种可构建高质量的基因集，为后续物种的功能研究奠定基础
- 胁迫抗逆机制：筛选胁迫、抗逆相关的差异表达基因/转录本，结合通路富集分析，增加对胁迫适应和耐受相关复杂调控网络的理解
- 合成代谢机制：研究生物合成或代谢机制，鉴定完整转录本，对重要代谢通路的关键基因或转录本进行深入探究，突破以往利用二代测序技术对生物的重要次级代谢产物生物合成的研究无法准确预测剪接亚型的限制
- 生长发育调控机制：研究不同发育时期转录组的动态变化，可以准确识别不同时期的转录本结构变化及基因或转录本的表达变化，有助于阐明植物生长发育的调控机理
ꁲ
ꁲ
ꁲ
