空间转录组测序/时空转录组测序
基于主流的10x Genomics Visium平台和华大Stereo-seq平台,解码DNA提供【10x Visium空间转录组测序】和【华大时空转录组学测序服务】。
产品详情
空间转录组测序(spa-tial transcriptomics sequencing,stRNA-seq)是在原始组织切片上实现mRNA的捕获和标记,构建文库并进行测序,同时能获得同一组织切片的组织学和表达谱信息的技术。该技术将显微成像与测序技术巧妙结合,使得研究人员在获取基因表达数据之际,能够最大程度获得样本的空间位置信息。
通过从空间维度全面地解读组织微环境的转录组信息,进而深入探究细胞在特定空间位置上的基因表达模式,揭示细胞与细胞之间、细胞与微环境之间复杂的相互作用关系,为理解疾病的发生发展机制以及制定更精准的治疗策略提供关键的信息支撑。现已广泛应用于肿瘤、免疫、发育学、病理、神经科学等领域。
解码优势
解锁更多样本类型
适用于大多数物种的多种组织类型,如脑、心脏、肿瘤等
分辨率高
超高分辨率可实现对单个细胞及分子信息的空间定位和检测
芯片配置灵活
多种规格芯片配置,方便研究者根据组织块大小灵活选择感兴趣的病理区域
分析简化
搭配可视化操作软件和易于使用的分析工具,简化分析流程
应用场景
发育生物学研究:发育过程中的时空基因表达图谱、与形态发生有关的基因挖掘
肿瘤研究:肿瘤免疫微环境、肿瘤细胞异质性、肿瘤发生发展机制肿瘤转移机制
免疫学研究:免疫细胞空间分布图谱、免疫细胞浸润、免疫细胞相互作用
神经科学研究:绘制大脑细胞层图谱和神经结构、神经损伤和修复机制
分析流程
服务流程