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华大单细胞转录组测序

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华大基因DNBelab C4单细胞测序平台基于负压驱动的液滴微流控系统,创新整合自主专利的Disc-seq液滴标签技术,通过超泊松分布的磁珠-液滴包裹机制,将携带唯一细胞标签(Cell Barcode)和液滴标签(Droplet Barcode)的磁珠与单个细胞/核共包裹于液滴内,在液滴内同步完成细胞裂解及mRNA捕获,借助磁珠polyT引物实现mRNA逆转录为双标签cDNA,并通过分离cDNA与Oligo产物分别构建文库,结合华大DNBSEQ™测序平台实现高通量检测。目前广泛应用于肿瘤微环境异质性研究、胚胎发育、克隆进化、疾病机理和人体免疫微环境等

 

技术原理

  • 单细胞悬液制备:将组织解离获得质量合格的单细胞悬液
  • 液滴生成:使用华大DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备试剂盒套装,通过单细胞液滴生成仪,将细胞悬液与逆转录反应的相关试剂混匀作为细胞相,含有标签信息的大磁珠和小磁珠作为磁珠相,通过液滴微流控技术生成液滴
  • 细胞裂解与反转录:在液滴中,细胞裂解释放mRNA,磁珠释放细胞条码和液滴条码,完成液滴内逆转录反应
  • 文库构建与测序:破乳回收cDNA中间产物和oligo产物,分别进行cDNA文库和oligo文库的构建,并进行上机测序
  • ​数据分析:通过条形码信息将测序数据分配到单个细胞,进行基因表达定量、细胞类型鉴定及功能分析

 

 

 

图 | DNBelab C4单细胞转录组原理图(来源:华大官方)

 

 

技术优势

  • 高通量测序能力:华大单细胞C4平台能够同时处理数千个单细胞,大大提高了数据获取的效率和准确性
  • 多维度数据分析:平台不仅提供基因表达数据,还能进行转录组、表观基因组等多维度分析,帮助科研人员全面理解细胞状态
  • 强大的数据处理能力:华大基因自主研发的生物信息学工具,能够高效处理海量数据,提供直观、易懂的可视化结果,助力科研人员快速得出结论
  • 广泛的应用领域:无论是肿瘤研究、免疫学、神经科学,还是发育生物学,华大DNBelab C系列单细胞测序平台都能提供定制化的解决方案,满足不同科研需求

 

应用方向

  • 细胞图谱构建:精准鉴定细胞类型,揭示组织细胞组成与异质性
  • 发育与分化研究:解析胚胎发育、组织形成及干细胞分化的分子机制
  • 疾病机制探索:研究肿瘤异质性、免疫微环境及疾病相关细胞亚群
  • 精准医学与药物研发:发现疾病标志物、药物靶点,推动个性化治疗方案
  • 多组学整合分析:结合表观组、蛋白组数据,深入解析基因调控网络

 

 

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