10x Xenium原位分析
10x Xenium 是一种组织原位分析技术，能够以亚细胞分辨率提供高灵敏度、大于5000个靶向基因的表达信息。Xenium分析仪将单分子RNA杂交与强大的光学、数据采集和解码技术相结合，可以在整个组织切片上一站式快速检测分析。该平台是目前唯一一种使用挂锁式探针滚环扩增化学技术的商业化原位分析平台，可兼容新鲜冷冻(FF)和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。在肿瘤生物学、神经科学、发育生物学、感染、药物研发等多个研究领域提供前所未有的独特解析视角。
技术原理
- 样本制备：将FF或者FFPE组织切片置于Xenium载玻片上（有效区域10.5mm × 22.5mm）；
- 样本处理：固定和透化处理（FF）或者脱蜡和解交联处理（FFPE）；
- 滚环扩增：探针与mRNA杂交，进行滚环扩增，扩大探针信号；
- 荧光探针杂交与成像：Xenium载玻片放置到Xenium 分析仪中进行荧光探针杂、循环成像、解码和数据分析，从而在切片原位获得目标基因的转录组图谱；
- 数据可视化：使用Xenium Explorer软件进行数据处理。
产品优势
- 高灵敏性、特异性：独特的挂锁式探针设计，增强了检测的灵敏性和特异性；
- 高分辨率：结合原位显微成像的方法，实现亚细胞水平的原位基因表达分析，大大提高了空间组学分辨率；
- 高通量：Xenium载玻片的成像区域大小为12mmx24mm，一次上机可并行检测两张玻片；满足横截面较大组织研究需求的同时，也可以在一张玻片上检测多张组织切片；
- 高灵活性：多种预制Panel可选，也可添加定制1-100个靶基因，满足特定研究的个性化需求；
- 高样本兼容性：能够识别短或高度降解的转录本，可兼容新鲜冷冻样本(FF)，福尔马林固定石蜡包埋样本、(FFPE)及组织矩阵样品(TMA)等各类常见临床转化样品类型；
- 非破坏性：Xenium的非破坏性分析能够在运行后保持组织形态完整性，可在同一张新鲜冷冻或FFPE切片上获得RNA、IF和形态学（H&E）信息，与组织病理学研究无缝整合。
应用方向
- 肿瘤微环境研究：解析肿瘤微环境中细胞类型和分子机制；
- 免疫研究：分析免疫细胞在组织中的分布和相互作用；
- 神经科学研究：研究神经细胞的表达模式和功能；
- 细胞特异性研究：揭示细胞特异性的基因表达模式；
- 生物标志物发现：发现其他技术可能忽略的细胞和疾病过程的新型生物标志物。
送样要求
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所需样本数量 |
质控标准 |
运输条件 |
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实验过程 |
数量 |
形态 |
RNA |
石蜡块 |
蜡膜/ 蜡卷 |
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RNA DV200质检 |
0.9cm*0.9cm,2张 0.6cm*0.6cm，2-3张 0.3cm*0.3cm，5-6张 穿刺等小样本建议＞7张 |
HE染色：确保组织形态完整，无断裂 |
● DV200≥30%：质检合格； ● DV200=26-29%：处于质控临界值，可尝试但存在较大风险，可能影响 UMI counts 及基因中位值，考虑临床样本珍贵性，可讨论汇报后确定下游实验正常进行； ● DV200<26%：不建议进行下游实验。 |
● 冰袋运输 ● 4℃入库 ●需要客户明确好切面 |
● 干冰运输 ● -80℃入库 |
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HE染色 |
1-2张5µm切片并染色 |
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Xenium正式实验 1张5µm 厚度切片（≤10.5mm x 22.5mm） |
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