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未命名__2024-04-25-10_16_48

全长转录组测序

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全长转录组测序是基于PacBio Revio平台的HiFi测序技术获得物种转录组信息的方法,其可以直接获得完整全长转录本序列及结构信息,无需打断和拼接,克服转录本拼接短、信息不完整的难题,实现可变剪切及融合基因等结构变异的研究。

 

实验流程

total RNA抽提质检→cDNA合成和纯化→cDNA扩增和纯化→Kinnex PCR→Kinnex 列阵形成和纯化→核酸处理和纯化→PacBio测序

 

 

送样建议

样本类型

建议送样量

total RNA

总量 ≥ 1μg, 浓度 ≥50ng/μL;

植物(根、茎叶、花、果实/种子、幼苗)

常规材料≥5g,特殊材料≥10g

人/动物

组织

常规材料≥2g,特殊材料≥5g,
保存液和酒精保存组织不可用于PacBio测序

细胞

≥5*107  细胞

全血

哺乳动物全血≥5mL , 鸟类,鱼类≥1 mL;
凝血不能提取

微生物

菌液

视菌液浓度而定,至少≥4mL

沉菌

大于 200mg

 

交付指标

测序平台

测序策略

交付周期

交付内容

PacBio Revio 平台

HiFi reads测序技术

55个自然日

交付bam文件

 

 

 

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