10x Atera 空间原位检测

Atera In Situ是10x Genomics于2026年4月在AACR年会上正式推出的新一代原位空间生物学平台，被10x Genomics CEO Serge Saxonov誉为“公司历史上最大的一次产品发布”。Atera旨在彻底打破空间生物学研究中长期存在的“不可能三角”——大视野、高分辨率与全转录组覆盖无法兼得的技术困局。

Atera平台实现了全转录组覆盖（>18,000个基因）、单细胞级灵敏度与超高样本通量的协调统一。该平台基于原位成像及多模态细胞分割技术，像素尺寸约0.2 μm，能够实现真正的单细胞甚至亚细胞分辨率。

10x Atera是基于挂锁式探针（Padlock Probe）+滚环扩增（RCA）+多轮荧光成像解码的原位空间转录组技术。核心是用双端基因特异性挂锁探针识别靶RNA，仅两端完全匹配才连接成环并经RCA放大信号；再通过多轮“荧光探针杂交–成像–淬灭”，为每个RNA分子赋予独特荧光条形码，最终解码得到单分子级、高分辨率的基因空间定位。

1）全转录组覆盖，无偏发现

   Atera WTA（全转录组）Panel 覆盖18,000+蛋白编码基因，实现在原位空间分析中不预设基因、无偏发现。捕捉完整的蛋白质编码转录组，获取更深层的生物学见解。

2）单细胞分辨率

基于原位成像及多模态细胞分割技术，像素尺寸约0.2 μm，能够实现真正的单细胞甚至亚细胞分辨率。

3） 超高灵敏度

Atera的灵敏度可媲美单细胞测序分析。实验数据显示，Atera WTA与Chromium Flex单细胞检测的基因检出相关性高达r²=0.75。在同一玻片上的两次技术重复中，细胞转录本数量的相关性达到r²=0.99，验证了平台的高稳定性和可重复性。相较于Xenium，Atera的单细胞中位转录本检出量提升了8-15倍。超高的灵敏度可以帮助研究人员检测组织微环境中的新细胞状态、新的细胞间相互作用以及稀有细胞类型。

4 ）超高样本通量：单次运行 2/4 张玻片，每年 800 个全转录组样本

· 每年可分析多达800个1 cm²的全转录组样本；

· 单次运行最多可同时检测4张玻片；

· 单张玻片有效成像面积超5 cm²，可轻松适配超大组织切片与组织芯片（TMA）检测需求；

· 单次运行总组织检测面积超2,000 mm²。

5 Panel灵活配置

（1）Atera WTA：18,000+基因全转录组，可叠加1,000个自定义基因。

（2）Atera Select：1,000基因预设计panel，可叠加形成2,000–3,000基因panel。

（3）Atera Custom：完全自定义 1,000 基因 panel，支持 SNV、异构体、CRISPR gRNA、病原体序列等。

1）肿瘤微环境研究：在组织原位全景解析肿瘤异质性、免疫浸润与细胞间相互作用；

2）神经科学研究：绘制脑组织空间转录组图谱，解析神经细胞类型与区域特异性；

3）发育生物学：追踪胚胎发育过程中的基因表达时空动态；

4）疾病机制探索：在临床FFPE样本中挖掘疾病发生发展的新机制与新生物标志物；

5）药物靶点发现：通过全转录组无偏筛选，发现新的治疗靶点；

6）转化医学研究：支持大规模临床样本的空间转录组分析。